Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx4Q6RUU0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms