Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb40Q6PCS8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms