Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg9aQ68FE2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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