Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn13Q64512 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn13Q64512 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn13Q64512 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ptpn13Q64512 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptpn13Q64512 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ptpn13Q64512 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ptpn13Q64512 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ptpn13Q64512 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ptpn13Q64512 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ptpn13Q64512 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ptpn13Q64512 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn13Q64512 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms