Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmoQ562D6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmoQ562D6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmoQ562D6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmoQ562D6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrmoQ562D6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TrmoQ562D6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TrmoQ562D6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmoQ562D6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms