Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MitfQ08874 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms