Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VldlrP98156 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms