Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bop1P97452 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bop1P97452 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms