Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa10P31310 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms