Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga1P29974 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga1P29974 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms