Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms