Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf5O35326 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms