Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efna3O08545 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efna3O08545 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms