Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trpv2Q9WTR1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trpv2Q9WTR1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms