Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod3Q9R0E1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod3Q9R0E1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms