Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gpc1Q9QZF2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc1Q9QZF2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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