Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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