Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx6Q9ER75 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms