Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm5Q9D806 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm5Q9D806 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms