Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spns3Q9D232 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms