Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan11Q9D1D1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms