Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gps1Q99LD4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gps1Q99LD4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms