Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrdQ8K2M3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms