Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc30Q8BVF4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc30Q8BVF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc30Q8BVF4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc30Q8BVF4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms