Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms