Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbtb40Q6PCS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb40Q6PCS8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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