Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg9aQ68FE2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg9aQ68FE2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms