Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrmsQ62270 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrmsQ62270 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms