Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd1Q61345 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Foxd1Q61345 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Foxd1Q61345 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Foxd1Q61345 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Foxd1Q61345 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Foxd1Q61345 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd1Q61345 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd1Q61345 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms