Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms