Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VldlrP98156 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VldlrP98156 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VldlrP98156 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VldlrP98156 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms