Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa11P50709 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa11P50709 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa11P50709 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa11P50709 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa11P50709 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa11P50709 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms