Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TfamP40630 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TfamP40630 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TfamP40630 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TfamP40630 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1307.8 ms