Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spi1P17433 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms