Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb3P09026 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms