Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01668 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01668 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01668 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01668 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01668 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01668 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01668 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01668 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01668 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01668 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01668 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01668 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01668 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms