Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vamp4O70480 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp4O70480 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms