Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna3O08545 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms