Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4aF8VPX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4aF8VPX6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms