Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf1B2RRD7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brpf1B2RRD7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms