Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms