Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Bco1Q9JJS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Bco1Q9JJS6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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