Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn19Q9ET38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms