Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan11Q9D1D1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1162.3 ms