Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms