Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnps1Q99M28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnps1Q99M28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms