Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sntg1Q925E1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sntg1Q925E1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms