Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atad2Q8CDM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atad2Q8CDM1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms