Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx4Q6RUU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx4Q6RUU0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms