Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmod2Q3UHZ5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmod2Q3UHZ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms